El municipio tiene 84 comunidades y 34 barrios, su cabecera municipal es Metztitlán. Los centros más poblados del Municipio son: Primero la cabecera municipal, le siguen nueve cabeceras de subsistemas, una localidad con servicios primarios y 70 localidades menores. Siendo sus principales comunidades: El pedregal, Zoquizoquipan, Fontezuelas el Pirúl, Itztayatla, San Pablo Tetlapayac, la Paila, el Carrizal y San Cristóbal.
| Clave de la Localidad | Nombre de la Localidad | Estatus | Ambito |
|---|
| 130370011 | Cerro Verde | Activa | Rural |
| 130370021 | La Cumbre Jagüey Seco (Jagüey Seco) | Activa | Rural |
| 130370030 | El Palmar | Activa | Rural |
| 130370040 | San Juan Tlatepexi | Activa | Rural |
| 130370052 | Tlamaya | Activa | Rural |
| 130370056 | Tolapa (Santiago Tolapa) | Activa | Rural |
| 130370064 | Cerro Partido | Activa | Rural |
| 130370067 | El Mamtha | Activa | Rural |
| 130370074 | Tablón Chico | Activa | Rural |
| 130370076 | Tierra Nueva | Activa | Rural |
| 130370097 | Las Presas | Activa | Rural |
| 130370098 | Puerto de las Pilas | Activa | Rural |
| 130370100 | La Rivera | Activa | Rural |
| 130370104 | Yerbabuena | Activa | Rural |
| 130370128 | Tierra Blanca | Activa | Rural |
| 130370130 | La Trampa | Activa | Rural |
| 130370136 | Cerro Boludo | Activa | Rural |
| 130370141 | El Rincón | Activa | Rural |
| 130370002 | Alumbres | Activa | Rural |
| 130370003 | San Pedro Amajatlán (Amajatlán) | Activa | Rural |
| 130370004 | La Paila de Anáhuac | Activa | Rural |
| 130370005 | Los Arcos | Activa | Rural |
| 130370006 | Atzolcintla | Activa | Rural |
| 130370007 | Ayacatzintla | Activa | Rural |
| 130370008 | Buena Vista | Activa | Rural |
| 130370009 | Cacalome (Acalome) | Activa | Rural |
| 130370012 | Coalquizque | Activa | Rural |
| 130370013 | Coyometeco | Activa | Rural |
| 130370014 | Chimalacatla | Activa | Rural |
| 130370015 | Fontezuelas | Activa | Rural |
| 130370017 | Huayateno | Activa | Rural |
| 130370018 | Huistícola | Activa | Rural |
| 130370019 | Itztayatla | Activa | Rural |
| 130370020 | Itztazacuala | Activa | Rural |
| 130370022 | Jihuico | Activa | Rural |
| 130370026 | La Mesa Grande (Mesa Grande) | Activa | Rural |
| 130370027 | Metznoxtla (Metznoztla) | Activa | Rural |
| 130370028 | Milpa Grande | Activa | Rural |
| 130370029 | Olotla | Activa | Rural |
| 130370032 | El Pirü Tepozotlán (El Pirü) | Activa | Rural |
| 130370033 | Pontadhó | Activa | Rural |
| 130370035 | Rincón de Coalquizque | Activa | Rural |
| 130370037 | El Salitre | Activa | Rural |
| 130370038 | San Cristóbal | Activa | Rural |
| 130370039 | San Juan Metztitlán | Activa | Rural |
| 130370041 | San Pablo Tetlapayac | Activa | Rural |
| 130370042 | San Pedro Ayotoxtla | Activa | Rural |
| 130370044 | Santa Mónica Autempa | Activa | Rural |
| 130370045 | El Tablón | Activa | Rural |
| 130370047 | Tepatetipa (San Agustín Tepatetipa) | Activa | Rural |
| 130370049 | Tezochuca | Activa | Rural |
| 130370051 | Tlamaxa | Activa | Rural |
| 130370053 | Tlatepexe | Activa | Rural |
| 130370054 | Tlaxco | Activa | Rural |
| 130370055 | Tlazoquitipa | Activa | Rural |
| 130370057 | Tres Cruces | Activa | Rural |
| 130370058 | Zoquiteno | Activa | Rural |
| 130370059 | Zoquizoquipan | Activa | Rural |
| 130370060 | Zotola | Activa | Rural |
| 130370061 | Zotoltepec | Activa | Rural |
| 130370062 | Agua Hedeonda | Activa | Rural |
| 130370065 | El Escobal | Activa | Rural |
| 130370068 | El Meje | Activa | Rural |
| 130370069 | San Antonio Tlaxco | Activa | Rural |
| 130370070 | Palo Blanco (Cacaloco) | Activa | Rural |
| 130370071 | Pie de la Cuesta | Activa | Rural |
| 130370072 | Pilas y Granadas | Activa | Rural |
| 130370073 | Pueblo Nuevo | Activa | Rural |
| 130370075 | Tecruz Cozapa | Activa | Rural |
| 130370077 | Tochintla | Activa | Rural |
| 130370087 | Hacienda de Potrero | Activa | Rural |
| 130370089 | Joya de Analco | Activa | Rural |
| 130370093 | Macuila | Activa | Rural |
| 130370094 | Metzquititla | Activa | Rural |
| 130370095 | Miahuatlán | Activa | Rural |
| 130370096 | Potrero de Camacho | Activa | Rural |
| 130370101 | Tepetlaco | Activa | Rural |
| 130370102 | Tezisco | Activa | Rural |
| 130370103 | Tepecahuantla | Activa | Rural |
| 130370107 | Rincón de Santa Cruz (Santa Cruz) | Activa | Rural |
| 130370108 | Cerro Blanco | Activa | Rural |
| 130370114 | El Arenal | Activa | Rural |
| 130370117 | Huixastla | Activa | Rural |
| 130370118 | La Laja | Activa | Rural |
| 130370121 | La Peña | Activa | Rural |
| 130370122 | Pie de la Cuesta | Activa | Rural |
| 130370129 | Tlaxco Viejo | Activa | Rural |
| 130370131 | Xocotitla | Activa | Rural |
| 130370140 | El Tezontle | Activa | Rural |
| 130370143 | El Güero | Activa | Rural |
| 130370144 | La Joya | Activa | Rural |
| 130370001 | Metztitlán | Activa | Urbano |
| 130370010 | El Carrizal | Activa | Rural |
| 130370016 | Hacienda de Guadalupe | Activa | Rural |
| 130370023 | Jiliapa | Activa | Rural |
| 130370024 | Jilotla | Activa | Rural |
| 130370031 | El Pedregal de Zaragoza (El Pedregal) | Activa | Rural |
| 130370043 | San Pedro Tlatemalco | Activa | Rural |
| 130370046 | Tecruz de Anáhuac (Tecruz de Jihuico) | Activa | Rural |
| 130370050 | Tlacotepec (Cerrito de Tlacotepec) | Activa | Rural |
| 130370066 | Estocuapa (La Colmena) | Activa | Rural |
| 130370083 | Apanco | Activa | Rural |
| 130370084 | Atzingo | Activa | Rural |
| 130370085 | El Banco (La Cumbre de Huistícola) | Inactiva | Rural |
| 130370088 | Higueras | Activa | Rural |
| 130370090 | Loma Ancha | Inactiva | Rural |
| 130370092 | Loma Cuata (La Cumbre de Loma Cuata) | Inactiva | Rural |
| 130370099 | Rincón Grande | Inactiva | Rural |
| 130370109 | Rincón Grande | Activa | Rural |
| 130370110 | Huiloco | Activa | Rural |
| 130370113 | Apanco | Activa | Rural |
| 130370115 | Barrio de Quinjuá | Inactiva | Rural |
| 130370116 | El Damh? | Inactiva | Rural |
| 130370119 | La Laja | Activa | Rural |
| 130370120 | Luisa Vargas Callejas | Inactiva | Rural |
| 130370123 | Pie de la Cuesta | Activa | Rural |
| 130370124 | La Cumbre de Huistícola | Inactiva | Rural |
| 130370125 | El Rincón (El Rincón de Ixcoatitla) | Inactiva | Rural |
| 130370126 | Rosa Blanca | Activa | Rural |
| 130370127 | Los Terreros | Inactiva | Rural |
| 130370132 | Barrio Coatlán | Activa | Rural |
| 130370133 | Barrio el Tepeyac | Activa | Rural |
| 130370134 | Cabeza de Toro | Activa | Rural |
| 130370135 | El Dezdhá | Inactiva | Rural |
| 130370137 | La Gasera | Inactiva | Rural |
| 130370138 | El Potrerillo | Inactiva | Rural |
| 130370139 | Rancho Nuevo de Guadalupe | Inactiva | Rural |
| 130370142 | Barrio el Calvario | Activa | Rural |
